טיפול הטיפול בפטרת עור משלב טיפול סיסטמי (טיפול כללי שניתן בכדורים לפה) וטיפול מקומי על העור עצמו במשחה ו/או שמפו מיוחד. הטיפול נמשך לפחות שבועיים לאחר שהפטריה נעלמה ולרוב לא פחות מארבעה שבועות. במקרים של זיהום מפושט בחתול ארוך שיער גם מומלץ לספר את החתול. חלק חשוב מהטיפול הוא למנוע זיהום סביבתי והדבקת בע"ח אחרים – לשם כך, יש לבודד את החתול הנגוע ואף לטפל בו בעזרת כפפות. כמו כן חשוב לשאוב אבק בבית, לכבס מצעים ולחטא כלים שהחתול משתמש בהם כגון ארגז החול, כלי אוכל, מיטת שינה וכדומה. אם יש חיות נוספות בבית יש לבדוק את כולם לפטרת.
לסיכום, מדובר במחלה שאינה נפוצה אך חשיבותה רבה מאוד בגלל הזיהום הסביבתי והסכנה לבע"ח אחרים ולבנ"א. לפני הטיפול חייבים להיות בטוחים שאכן מדובר בפטריה כי מדובר בטיפול לטווח ארוך שדורש סבלנות רבה ויש בעיות עור אחרות שיכולות להראות דומה אך עם טיפול שונה לחלוטין. לכן, כאשר מופיעה בעיית עור בחתול, גם אם היא נראית קטנה ושאינה מפריעה יש לקחת את החתול לבדיקה אצל הווטרינר.